Hallo Matthias,
ich fahre zwar nicht im DCC auf 2-Leiter-Gleisen, aber Deine Beschreibung liest sich so, dass die Lok und der letzte Wagen die Besetztmeldung auslösen, die Wagen hinter der Lok bis zum Schlusswagen jedoch keine meldenden Achsen haben. So kommt es, dass für die Länge dieser Wagen keine Besetztmeldung ausgelöst wird, was am Monitor dann als nicht belegte Strecke angezeigt wird.
Hier hilft nur, entweder die Wagen zu beleuchten, damit ein Stromverbrauch vorhanden ist, oder je Wagen wenigstens eine Achse als "stromverbrauchend" mit Hilfe eines Widerstandes ausgerüstet wird.
Sicher gibt es auch noch andere technische Lösungen, da müssen Dir aber die Spezialisten aus dem Bereich digitaler Gleichstrombetrieb weiterhelfen.